2001年9月建成，2003年开馆。馆舍建筑仿良渚文化典型器物玉琮图案，建筑面积8080平方米，总投资6000万元，有5000余件珍贵文物展出。其中，100余件出土的良渚文化精美玉器是余杭博物馆的一大特色，是一座展示余杭历史文化、良渚文化、江南水乡文化的综合性博物馆，是了解余杭、解读江南水乡文化的重要窗口。